知网查重查目录出现重复可能是由于系统缓存问题、网络连接不稳定、或者文件命名重复等原因导致。解决方法可以尝试清除系统缓存、检查网络连接、修改文件命名等。另外，也可以尝试重新登录知网账号，或者联系知网客服寻求帮助。

在处理知网查重查目录重复的情况时，还可以尝试使用不同的浏览器进行操作，或者清除浏览器缓存和cookie。另外，检查本地文件是否真的存在重复，可以通过更改文件保存路径或者调整文件命名方式来避免重复。如果问题仍然存在，建议及时联系知网官方客服获得进一步支持。