知网查重是学术界常用的反抄袭工具，对参考文献的影响主要体现在查重结果的处理上。若参考文献被查重系统误判为抄袭，可能会影响论文的原创性评价，甚至导致论文被拒。应对这种情况，作者可以提供详细的参考文献列表，确保引用规范，避免误判。此外，及时了解查重系统的更新和规则变化，有助于更好地应对查重带来的影响。

另外，知网查重系统对参考文献的查重结果也可能受到文献库覆盖范围的影响，某些非主流文献可能未被系统收录，导致查重结果不准确。为了应对这种情况，建议作者在写作过程中尽量引用主流、权威的文献，减少非主流文献的使用。同时，对于被查重系统误判的情况，作者可以通过向编辑部或相关机构申诉，提供详细的证据，维护自身的学术声誉。